Cuando los Asuranos lanzaron un ataque que obligó a la expedición a mover Atlántis, Weir resultó gravemente herida y sufrió daño cerebral como resultado. Rodney McKay utilizó los nanitos desactivados que habia en su cuerpo para reparar el daño. Esto tuvo como efecto secundario poder interactuar directamente con el colectivo de Replicantes, como resultado, acompañó el equipo de Sheppard en una misión para recoger un módulo de punto cero de Asuran, pero el equipo descubrió un código que podría provocar que los Asuranos cumplieran su orden principal que era atacar a los Wraith. Weir logró retrasar a los Asuranos, pero Oberoth, su líder, físicamente la agarró. Weir ordenó a Sheppard que se marchase con el equipo, y ella se quedó atrás. Según una versión Replicante de Jennifer Keller, Weir fue posteriormente asesinado por su Oberoth considera una amenaza demasiado grande. (ATL: "First Strike", "Adrift", "Lifeline", "This Mortal Coil") se reveló que no era, de hecho, muerto pero de alguna manera se convirtió en un miembro o dirigente de un grupo de replicadores que dejó el grupo principal. Weir cree que con la Asuranos muertos, que pueden poner en práctica su plan sin tener que mirar sobre sus hombros más. (ATL: "Sé todos mis pecados recordados")Se reveló que su grupo era en realidad lo que quedaba del grupo Niam que estaba buscando la ascensión. Sólo había nueve izquierda como Elizabeth. Ella y su grupo ascendió digitalmente, pero quedaron atrapados. En un intento desesperado de recuperar la forma que physcial autostop junto con Sheppard y su equipo en un jumper. Ella tomó el control de los sistemas informáticos de la Atlántida y, finalmente, utiliza la tecnología de la ciudad para construir a sí misma un nuevo órgano, aunque uno que se parece a FRAN. Explicó que nunca murió, pero se convirtió en un
elizabet en el espacio
replicador de lleno cuando ella fue capturada. Su ser humano sigue siendo a pesar de ser un replicador y sólo se detectó por los miembros del
grupo de Niam. Ese grupo terminó en la carrera hasta los Replicantes otras fueron destruidas en la Batalla de Asuras. Se convocó a los otros con la esperanza de que ser capaz de construirse nuevos organismos con la misma tecnología que le dio uno y ultimatly propone que los Replicantes construirse los cuerpos humanos para vivir Cuando Koracen va deshonestos y trató de escapar, salvo Sheppard de él y mató a Koracen. Se dio cuenta de que cometió un error y que ella y los Replicantes fueron otros demasiado de una amenaza a la Atlántida.
Luego ella y su grupo por medio de la stargate partieron al espacio donde quedo congelada a la deriva.